Avancerad screening av nya miljöföroreningar i näringskedjor

Institutionen för växtproduktionsekologi Biologi inriktning ekologi - Institutionen för växtproduktionsekologi söker en doktorand inom växtförädling och växtskydd mot skadeinsekter Arbetsuppgifter: Kemiska insekticider har länge varit ett viktigt verktyg för att begränsa skördeförluster till skadeinsekter och insektsöverförda virus men tillgången har minskat kraftigt under de senaste åren. Sorter med resistens, tolerans eller med andra egenskaper som medger undkommande av insektsskador och virus som sprids av insekter kommer därför att vara en hörnsten i framtidens integrerade växtskydd. Visionen för det nya projektet Nod för växtförädling mot skadeinsekter och virus inom centrat SLU Grogrund är att genom växtförädling bidra till att kraftigt begränsa skördeförluster orsakade av skadeinsekter och insektsöverförda virus. Projektet arbetar med skadeinsekter och virus i vete, åkerbönor, ärter och sockerbetor och är ett samarbete mellan fem institutioner på SLU och tre växtförädlingsföretag. Vi söker nu en mycket motiverad person för en doktorandtjänst som inom Noden kommer att arbeta med inriktning mot skadeinsekten bönsmyg i åkerböna. Angrepp av bönsmyg utgör i nuläget ett hinder för att utveckla odlingen och marknaden för åkerböna till humankonsumtion. Inom ramen för forskarutbildningen ingår både forskningsstudier och kurser. De huvudsakliga arbetsuppgifterna inom forskningsstudierna kommer att vara: Kartlägga insektens livscykel i fält och lager Utveckla metodik för screening av angrepp av bönsmyg i en stor panel av växtförädlingsmaterial Bidra till att utveckla DNA-markörer för tolerans och resistens mot bönsmyg för framtida tillämpning inom växtförädling Du kommer att samarbeta inom projektet med andra doktorander och seniora forskare inom växtförädling, växtodling, entomologi, virologi och genetik samt med näringen och andra intressenter, främst Lantmännen och NordGen. Laboratorie- och fältarbete planeras genomföras både vid SLUs campus i Uppsala och Alnarp, samt hos NordGen i Alnarp. Även fältarbete på andra platser i Sverige kan ingå. Kvalifikationer: Vi söker en kandidat som har: Examen på avancerad nivå (masterexamen) i agronomi, hortikultur, växtbiologi, växtskydd eller annat närliggande ämnesområde. Erfarenhet av statistisk analys av data. Erfarenhet av arbete med växter eller insekter i fält eller växthus. Starkt intresse för växtskydd och växtförädling. Mycket god förmåga att uttrycka dig i tal och skrift på engelska. Meriterande: Erfarenhet av eller kännedom om grödor och jordbruk. Körkort som är giltigt i Sverige. Vi lägger stor vikt vid personliga egenskaper såsom förmåga att arbeta både självständigt och tillsammans med andra, ta initiativ, hantera komplexa uppgifter på ett strukturerat sätt samt bidra positivt till en arbetsmiljö som präglas av samarbete över discipliner och länder. Behörighet: För att vara behörig till utbildning på forskarnivå krävs avlagd examen på avancerad nivå eller minst fyra års heltidsstudier varav minst ett år på avancerad nivå. Urval bland de behöriga sökande baseras på: skriftlig ansökan inklusive meritförteckning; examensarbete, kopior av examensbevis och registerutdrag från tidigare studier på grund- och avancerad nivå vid universitet eller högskola, två personliga referenser, kunskaper i engelska. Mer information om krav på engelska kunskaper finns på följande sida: https://www.slu.se/utbildning/program-kurser/forskarutbildning/att-bli-doktorand/ Observera att den/de sökande som blir kallade till intervju ska lämna in vidimerade kopior av examensbevis, eller motsvarande, och registerutdrag från tidigare studier på grund- och avancerad nivå vid universitet eller högskola, samt att de sökande som har utländskt medborgarskap också ska lämna in en vidimerad kopia av den sida i passet som innehåller foto och personinformation. Läs mer om SLU:s forskarutbildning på https://www.slu.se/utbildning/studera/forskarutbildning/ Om oss: Institutionen för växtproduktionsekologi är en del av Ekologicentrum och erbjuder, tillsammans med Institutionen för ekologi, en dynamisk och inspirerande forskningsmiljö. Vi utvecklar kunskap om motståndskraftiga och hållbara växtproduktionssystem för att möta kraven på mängd och kvalitet avseende livsmedel, djurfoder och biobaserade råvaror i en föränderlig värld. Forskningen fokuserar på de utmaningar som uppstår till följd av ökad efterfrågan, klimatförändringar, miljöpåverkan och förlust av biologisk mångfald kopplat till jordbruks- och livsmedelssystem. Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom SLU på https://www.slu.se/om-slu/jobba-pa-slu/ Läs mer om institutionen för växtproduktionsekologi på https://www.slu.se/om-slu/organisation/institutioner/vaxtproduktionsekologi/ Försörjningsform och lön: Anställning som doktorand, 4 års utbildning. Lönen för doktorandanställningen följer lokalt kollektivavtal med fasta lönesteg. Omfattning: 100% Placering: Uppsala Tillträde: 1 oktober 2026 eller enligt överenskommelse. Ansökan och urval: Välkommen med din ansökan via ansökningsknappen nedan senast 2026-08-16. Läs mer om de bilagor som din ansökan ska innehålla på https://www.slu.se/utbildning/studera/forskarutbildning/hur-kan-jag-bli-doktorand/ansokan-och-bilagor/ Urval bland behöriga sökande sker baserat på de bilagor som bifogas i ansökan, och ska göras med hänsyn till förmåga att slutföra utbildningen inom utsatt tid. Fackliga kontaktpersoner https://internt.slu.se/min-anstallning/facket/kontaktpersoner/ Sveriges lantbruksuniversitet (SLU) har en nyckelroll i utvecklingen för hållbart liv, grundad i vetenskap och utbildning. Genom vårt fokus på samspelen mellan människa, djur och ekosystem och ett ansvarsfullt brukande av naturresurserna bidrar vi till en hållbar samhällsutveckling och goda livsvillkor på vår planet. Huvudorter är Alnarp, Umeå och Uppsala, men verksamhet bedrivs också på forskningsstationer, försöksparker och utbildningsorter i hela landet. SLU har drygt 4000 medarbetare, 6000 studenter och forskarstuderande och en omsättning på över 4,5 miljarder kronor. Universitetet satsar på attraktiva miljöer på sina campusområden. Vi arbetar för en jämställd och inkluderande arbetsmiljö där öppna samtal mellan människor med olika erfarenheter lägger grunden för vetenskaplighet, kreativitet och utveckling. Vi välkomnar därför personer med olika bakgrunder och perspektiv att söka den aktuella anställningen.

Doktorand i AI och maskininlärning för cancerforskning Institutionen för immunologi, genetik och patologi vid Uppsala universitet har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inriktade på bl.a cancer, autoimmuna och genetiska sjukdomar. En av grundtankarna vid institutionen är att stimulera translationell forskning och därmed en närmare samverkan mellan medicinsk forskning och sjukvården.Läs gärna mer om institutionen här: https://www.uu.se/institution/immunologi-genetik-och-patologi Vill du använda artificiell intelligens och maskininlärning för att förstå — och programmera om — beteendet hos en av världens farligaste cancersjukdomar? Vi söker en doktorand som vill bedriva forskning i världsklass kring glioblastom: en hjärntumör vars dödlighet inte drivs av spridning till andra organ, utan av dess förmåga att kontinuerligt byta biologisk karaktär och invadera hjärnvävnaden. Med oss får du möjligheten att kombinera spjutspetsig AI-metodutveckling med direkt experimentell validering, i en internationell forskningsmiljö med starka samarbeten och unika resurser. Forskargruppen leds av professor Sven Nelander vid IGP Uppsala universitet. Vi arbetar i skärningspunkten mellan AI/maskininlärning, systembiologi och experimentell neuro-onkologi. Vår grupp har under mer än ett decennium byggt upp unika resurser: en biobank med över 100 patientavledda glioblastomceller (distribuerade till 54 laboratorier i 17 länder), storskalig Perturb-seq-data, egenutvecklade CRISPR-reporterverktyg och ett prototypsystem för multimodal AI. Gruppen är en del av det nationella strategiska forskningscentrumet CNSx3 och har koppling till UUniFIs AI-institute. Ett unikt sammanhang för spjutspetsforskning med verklig tvärvetenskaplig karaktär. Projektet finansieras av Vetenskapsrådet, Cancerfonden, KAW och SSF. Arbetsuppgifter Det grundläggande problemet vi vill lösa är att förstå hur celler i en hjärntumör väljer att byta karaktär — och hur vi kan använda den kunskapen för att aktivt styra dem mot mer behandlingskänsliga tillstånd. Vi kallar detta state steering. Till skillnad från konventionell cancerterapi, som syftar till att döda tumörceller med brett verkande terapier, syftar state steering till att omprogrammera dem. Via omprogrammeringen uppnås en rad effekter, såsom minskad invasion, ökad känslighet till strålning, eller senescens. Du kommer att arbeta med två huvudsakliga typer av data som samlas in inom ramen för det strategiska forskningscentrumet CNS×3: storskaliga interventionsexperiment, där vi systematiskt kartlägger hur genetiska och farmakologiska störningar påverkar tumörcellernas plasticitet, samt bildbaserad spårningsdata, där enskilda tumörceller följs i realtid när de vandrar genom hjärnvävnad. Målet är att bygga AI-modeller som samlar dessa datakällor och kan förutsäga hur en given behandling påverkar tumörens beteende och utfall.  Befintliga verktyg som gömda Markov-modeller (HMM), som används för att analysera enskilda cellers rörelser i bilddata, är specialfall av detta ramverk. Det nya bidraget, rewire-seq, är en mer generell och dataskalbar version som kombinerar storskaliga interventionsexperiment med bildbaserad cellspårning för att ge en sammanhållen bild av tumördynamiken. En nyckelkomponent i projektet är cyklisk experimentering: modellens prediktioner styr direkt valet av nästa experiment, och resultaten återmatas in i modellen — en process som gör forskningen progressivt mer precis. Du arbetar nära experimentella kollegor i en teambaserad miljö och omvandlar gemensamt biologiska frågor till beräkningslösningar med klinisk relevans. Kvalifikationskrav Behörig till utbildning på forskarnivå är den som har - avlagt examen på avancerad nivå inom beräkningsbiologi, bioinformatik, maskininlärning, tillämpad matematik, biofysik, molekylärbiologi, eller liknande, eller - fullgjort minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå inklusive ett självständigt arbete om minst 15 högskolepoäng, eller - på något annat sätt förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper. Projektet kräver solid förståelse av den matematik som ligger till grund för AI och maskininlärning — exempelvis linjär algebra, sannolikhetslära och statistisk inferens. Du bör ha konkret erfarenhet av krävande dataanalyser, t.ex. inom genomik, bildanalys eller biokemiska screeningdata. Starka programmeringsfärdigheter i Python, R eller annat språk är nödvändigt. Vi är öppna för sökande med potential att kombinera experimentellt och beräkningsbaserat arbete. Projektet passar dig som på lång sikt vill arbeta med spjutspetsforskning inom akademi eller industri. Stor vikt läggs vid personlig lämplighet. Utmärkt talad och skriven engelska krävs i rollen. Önskvärt/meriterande i övrigt Erfarenhet av analys av single-cell RNA-sekvensdata, CRISPR-screening, eller bilddata. Erfarenhet av djupinlärning eller grafneurala nätverk. Erfarenhet av modellering av dynamiska system eller systemkontroll. Tidigare erfarenhet av metodutveckling eller publicerad forskning. Intresse för cancerbiologi och förmåga att formulera biologiska hypoteser utifrån data. Bestämmelser för doktorander återfinns i Högskoleförordningen 5 kap §§ 1-7 samt i universitetets regler och riktlinjer. Om anställningen  Anställningen är tidsbegränsad, enligt HF 5 kap § 7. Omfattningen är heltid. Tillträde snarast möjligt eller enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala Upplysningar om anställningen lämnas av: Sven Nelander, sven.nelander@igp.uu.se. Välkommen med din ansökan senast den 16 augusti2026, UFV-PA 2026/1605. Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet https://uu.se/om-uu/jobba-hos-oss/ Anställningen kan komma att säkerhetsprövas. Vid säkerhetsprövning är en förutsättning för anställning att sökande blir godkänd. Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp. Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem. Fackliga företrädare: Saco-S - saco-s@uu.se, Seko - seko@uadm.uu.se, ST (OFR/S) - ofr@uu.se